Värjäävät elintarvikkeet on tehty perinteisistä elintarvikeraaka-aineista kuten kasveista, hedelmistä ja mausteista. Värit on standardisoitu raaka-aine lähteelle tyypillisen värin ja maun mukaan. Näitä värejä voidaan käyttää ilman E-numeroa ja niitä ovat mm. punajuuri, paprika, kurkumajuuri, poltettu sokeri, mustaporkkana ja pinaatti.